⒈用于做Western 或ELISA的一抗可否用于流式細(xì)胞術(shù)？
看你說明書上是怎么說的了，如果沒有說就不可以做流式，需要另外買了。
⒉請(qǐng)問流式細(xì)胞術(shù)單抗直接熒光需要幾種對(duì)照？
首先確認(rèn)你用的直標(biāo)抗體的熒光染料是什么，再確定該抗體的來源種屬，選擇相應(yīng)的同型對(duì)照。如：你現(xiàn)在想檢測(cè)小鼠淋巴細(xì)胞表面的CD4抗原， 熒光染料為FITC， 抗體來源為大鼠的IgG1亞型， 即Rat anti Mouse CD4-FITC （IgG1）， 你所需要的同型對(duì)照就應(yīng)該是Rat IgG1-FITC， 一般的抗體說明上都會(huì)寫清。
⒊6孔板的細(xì)胞量能否做流式呀？
對(duì)于6孔板而言，每孔的表面積為10 cm2，依細(xì)胞種類不同在長(zhǎng)滿時(shí)達(dá)到的數(shù)量從5*10的5次方到5*10的6次方不等。6孔板沒問題的！甚至24孔板也可以正常做。不過用于調(diào)試儀器參數(shù)的正常細(xì)胞要多準(zhǔn)備一些。
⒋流式中檢測(cè)細(xì)胞表面和細(xì)胞內(nèi)蛋白表達(dá)水平的抗體有何區(qū)別？
抗體只是針對(duì)相應(yīng)抗原的，至于是針對(duì)胞內(nèi)還是胞膜對(duì)你檢測(cè)來說并無明顯影響，你只需要查清楚到底是針對(duì)哪一個(gè)部位的抗原的，應(yīng)該是可以用同一種抗體進(jìn)行檢測(cè)的，在流式操作時(shí)只需注意：如果是針對(duì)胞內(nèi)，則需要加破膜劑，讓抗體能和相應(yīng)抗原接觸，否則就不需要了。
⒌只要是熒光抗體就可以用于共聚焦顯微鏡嗎？
一般情況下都是可以的。但有時(shí)候強(qiáng)度不夠，需要選擇熒光強(qiáng)度大的染料。
⒍流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞周期是否需要雞紅細(xì)胞作參照？
不用，標(biāo)準(zhǔn)微球做完laser alignment（光路校正）就可以了。盡量把微球的各色CV值控制在1.5以內(nèi)。
⒎流式細(xì)胞儀上的FL2-W FL2-A FL2-H 分別是做什么的？
FL2-W是只檢測(cè)熒光的脈沖寬度， FL2-H是指脈沖高度。通常在做細(xì)胞周期分析時(shí)應(yīng)用，用于去除粘連細(xì)胞。
⒏細(xì)胞膜蛋白變化是用流氏檢測(cè)好，還是要做western?
膜蛋白的提取，好像很費(fèi)功夫，提取的不好，western結(jié)果也就不可信。流式需要的抗體很少，流式能夠檢測(cè)陽(yáng)性表達(dá)細(xì)胞的比例，western能對(duì)總的表達(dá)定量，各有有缺點(diǎn)。
⒐培養(yǎng)細(xì)胞的bcl-2及Bax蛋白的檢測(cè)？
首先制成單細(xì)胞懸液，PBS洗滌后用胞內(nèi)染色試劑盒（很多公司都有，其實(shí)就是固定劑加增透/打孔劑）進(jìn)行處理，再進(jìn)行抗體孵育標(biāo)記染色，洗滌后上樣。
⒑如何分選原始紅細(xì)胞？
CD71（轉(zhuǎn)鐵蛋白受體）--幼稚細(xì)胞的標(biāo)記
CD235（GPA）--紅細(xì)胞的標(biāo)記（小鼠有Ter119）
雙陽(yáng)性細(xì)胞即為幼稚紅細(xì)胞，但無法區(qū)分原始及中晚幼紅.
⒒怎樣選擇流式同型對(duì)照？
同型對(duì)照（Isotype Control）：使用與一抗相同種屬來源、相同亞型、相同劑量和相同的免疫球蛋白及亞型的免疫球蛋白，用于消除由于抗體非特異性結(jié)合到細(xì)胞表面而產(chǎn)生的背景染色。如果一抗是多抗，可以用an normal serum（與一抗相同的正常血清） （must be the same species as primary antibody）。This control is easy to achieve and can be used routinely in immunohistochemical staining.這個(gè)可以咨詢?cè)噭┥獭Ｍ蛯?duì)照為免疫熒光標(biāo)記中的陰性對(duì)照。由于熒光標(biāo)記單抗的組來源不同，應(yīng)選用相同來源的未標(biāo)記單抗作為同型對(duì)照來調(diào)整背景染色。舉個(gè)例子：比如檢測(cè)一抗為單抗的mouse anti rat CD11b，clone OX-42 purified IgG，那么它的isotype 是mouse IgG2a， 所以可以用purified（純化的） mouse IgG2a來做OX-42的同型對(duì)照（Isotype Control）。一般的的生物技術(shù)公司和國(guó)內(nèi)的代理都有出售。
同型對(duì)照：是指與MoAb相同的、未免疫小鼠的免疫球蛋白亞類，若使用直接免疫熒光染色法，同型對(duì)照也應(yīng)標(biāo)記熒光色素，如IgG1 FITC、IgG2ａ、PE等。主要考慮了細(xì)胞的自發(fā)熒光、FC受體介導(dǎo)的抗體結(jié)合和非特異性抗體結(jié)合等影響因素。此外，同型對(duì)照與MoAb所標(biāo)記的熒光色素、濃度、F：P比值（標(biāo)記的熒光色素與免疫球蛋白分子的比值）應(yīng)該相同，這對(duì)準(zhǔn)確設(shè)定陰性與陽(yáng)性細(xì)胞的界標(biāo)有重要意義，切忌使用與MoAb不相匹配的同型對(duì)照，為同一實(shí)驗(yàn)室、采用相同工藝或方法制備（如同一品牌）的產(chǎn)品。
⒓流式細(xì)胞技術(shù)測(cè)定細(xì)胞內(nèi)游離鈣濃度為何要使用氯化鈣。
在文獻(xiàn)及其他專業(yè)網(wǎng)站中都有測(cè)定游離鈣的方法，具體如下：
（1） 鈣熒光探針負(fù)載；
（2）隨機(jī)測(cè)定每管細(xì)胞懸液樣品（以下簡(jiǎn)稱樣品）的單個(gè)細(xì)胞的熒光強(qiáng)度，記為F值。
（3）加入10%Triton X 100，（破膜用）；加入1 mmol/L氯化鈣，（問題所在），吹打均勻，孵育1~10min，測(cè)定熒光即Fmax值。
（4）加入EGTA，20μl（鈣螯合劑），孵育1~10min，激發(fā)波長(zhǎng)488nm測(cè)定熒光，即Fmin值。這個(gè)過程中的氯化鈣的作用如何， 請(qǐng)高人指點(diǎn)， 謝謝。
因?yàn)檎Ｑ獫{中Ca2＋濃度是1mM，細(xì)胞外液的Ca2＋對(duì)細(xì)胞內(nèi)Ca2＋有影響。加0.1%triton是增加膜通透性，使細(xì)胞外Ca2＋進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)，作為大值。加EGTA是為了螯合Ca2＋，作為小值.生理環(huán)境中細(xì)胞內(nèi)鈣離子濃度遠(yuǎn)低于細(xì)胞外液（大約1：10000），細(xì)胞膜對(duì)鈣的通透性變化對(duì)細(xì)胞內(nèi)鈣影響很大。
⒔流式與werstern的區(qū)別有哪些？
（1）Western 是檢測(cè)蛋白表達(dá)的金標(biāo)準(zhǔn)，可用于檢測(cè)細(xì)胞多種類型的蛋白；流式細(xì)胞術(shù)的方法多用于檢測(cè)細(xì)胞膜蛋白，雖然也可通過Triton-X100給細(xì)胞打孔的方法來檢測(cè)胞內(nèi)蛋白，但對(duì)于分泌蛋白卻是無能為力的；
（2）Western測(cè)蛋白含量對(duì)抗體的量需要很少，一般1：1000左右，而流式對(duì)抗體的需要量很大，一般1：50（很浪費(fèi)抗體）；
（3）采用Western方法檢測(cè)細(xì)胞蛋白含量的變化一般要有內(nèi)參，而流式一般要把每個(gè)樣品分為兩份，同時(shí)都做只加二抗（FITC標(biāo)記的）的對(duì)照，這樣平均到每個(gè)細(xì)胞的發(fā)光就不用內(nèi)參了；
（4）就個(gè)人經(jīng)驗(yàn)而言，流式用多抗不好，單抗標(biāo)出來不錯(cuò)。
不過流式的應(yīng)用原理主要還是抗原和抗體反應(yīng)和western、免疫組化沒有本質(zhì)差別，但是由于免疫組化和western都有酶催化底物的放大體系，因此，流式不適合檢測(cè)低表達(dá)的蛋白，低表達(dá)的還是采用western（尤其是化學(xué)發(fā)光底物更佳）和免疫組化更好。當(dāng)然，流式大的一個(gè)特點(diǎn)就是，可以定量（百分比），如果是高表達(dá)的用流式細(xì)胞儀非常有優(yōu)勢(shì)。
⒕FL1， FL2， FL3 的區(qū)別是什么? 是指在不同位置測(cè)得的熒光?還是不同波長(zhǎng)的熒光?這3個(gè)參數(shù)到底測(cè)的是什么?有什么意義?
你的理解是正確的，其實(shí)FL1， FL2， FL3 是指不同的熒光通道.舉個(gè)例子來說吧.我們用FITC/PE雙標(biāo)記的細(xì)胞，在488nm的激光激發(fā)下，這兩種熒光染料分別發(fā)出波長(zhǎng)不同的綠色和橙色熒光，然后這發(fā)出的熒光再通過濾光片分開，對(duì)應(yīng)的是不同的波長(zhǎng)的濾光片，一般在fl1那的是530nm的濾光片，在FL2那的是575nm的濾光片，這樣就可以把在一起的熒光分開了。
⒖MFI和GFI的意義？
Geo Mean，叫做幾何均數(shù)（geometric mean），常用于等級(jí)資料和對(duì)數(shù)正態(tài)分布資料，和常用的算數(shù)均數(shù)（mean）的計(jì)算方法不同。“ %total或者%gate的結(jié)果”代表的是百分率，即細(xì)胞占總體細(xì)胞或者是門內(nèi)細(xì)胞的百分比；用百分比作為統(tǒng)計(jì)指標(biāo)，適用于熒光表達(dá)較強(qiáng)的指標(biāo)。我看到你的流式圖上，檢測(cè)樣本的熒光強(qiáng)度不是很強(qiáng)，屬于弱表達(dá)的指標(biāo)，若用百分率統(tǒng)計(jì)，就是會(huì)失去一部分弱陽(yáng)性的數(shù)據(jù)。我建議可以用平均熒光強(qiáng)度（也就是mean值）作為統(tǒng)計(jì)指標(biāo)，比較熒光強(qiáng)度的變化。
⒗流式技術(shù)中的APC，pure 標(biāo)記是什么意思呢?
熒光物質(zhì)通常是指那些在受到一個(gè)波長(zhǎng)激發(fā)后，處于一個(gè)能量不穩(wěn)定的狀態(tài)，能發(fā)射一個(gè)波長(zhǎng)比激發(fā)波長(zhǎng)長(zhǎng)的光的一類物質(zhì)。當(dāng)然熒光并不都是受激發(fā)后發(fā)射的，如一些生物可以發(fā)射熒光，如熒火蟲，發(fā)光細(xì)菌等，他們發(fā)出的光是通過體內(nèi)的酶促反應(yīng)而產(chǎn)生的，這個(gè)酶通常被稱為熒光素酶.EB是一種熒光物質(zhì)，它在受到紫外線照射后可以發(fā)出一可見光，常用于DNA、RNA電泳中。
APC英文全名：allophycocyanin；中文名：別藻青蛋白；大吸收峰：650nm，大發(fā)射熒光峰：660nm，適用于雙激光流式儀，可被600-640nm波長(zhǎng)的激光激發(fā)。
PerCP英文全名：peridinin chlorophyll protein，中文名：多甲藻葉綠素蛋白；大激發(fā)波峰490nm，被488nm的氬離子激光激發(fā)后，發(fā)射光峰值約為677nm，與FITC、PE進(jìn)行多色熒光染色補(bǔ)償重疊較少，非特異性結(jié)合也較少。雖然較易使用，但量子產(chǎn)量不高，多用于檢測(cè)表達(dá)較高的抗原。
⒘怎樣用流式細(xì)胞儀來鑒定小鼠BMDC？
檢測(cè)小鼠BMDC主要是從形態(tài)學(xué)和細(xì)胞表面分子兩方面來鑒定我做的時(shí)候就做了普通光鏡下形態(tài)、電鏡（掃描和透射），另外檢測(cè)了小鼠BMDC表面的共刺激分子如CD86 、CD11、CD80。還做了MHC II類分子的檢測(cè)，還有MHCI類分子的檢測(cè)，這些分子在DC表面都不是特異存在的，在巨噬細(xì)胞、淋巴細(xì)胞表面也有表達(dá)，所以目前并沒有非常特異性的方法檢測(cè)你的細(xì)胞一定就是DC，但是從形態(tài)和表面分子的檢測(cè)結(jié)合來看，效果就比較好了.一般在幼稚的DC上述分子表達(dá)水平較低，DC成熟過程中，上述分子表達(dá)呈上調(diào)趨勢(shì)，你可以在不同的培養(yǎng)時(shí)間分別檢測(cè)。
⒙血液里的mononuclear cell（除外紅細(xì)胞，血小板和破碎的細(xì)胞碎片），能不能用細(xì)胞大小來gating，只看我關(guān)心的細(xì)胞？
（1）紅細(xì)胞還是小一些，無法100%區(qū)分，但還是可用把大部分紅細(xì)胞gate掉。
（2）溶血也很重要，如果你的紅細(xì)胞多的話。（我猜不少，如果用ficol的話）?？梢杂寐然@溶液，如ACK（Lonzo），
（3）CD45是所有白細(xì)胞都表達(dá)的，可以用來區(qū)分RBC vs. WBC
⒚FCM檢測(cè)表達(dá)結(jié)果到底是用百分比還是MFI。
我作出是單峰，原本我覺得用MFI表示較好。但我做的2個(gè)蛋白很奇怪，一個(gè)表達(dá)率高，但MFI值低；另一個(gè)表達(dá)率低，但MFI值高。我又作了SYBR GREEN 定量PCR，發(fā)現(xiàn)mRNA 的表達(dá)基本與百分比相符，而與MFI值不太一致。
個(gè)人認(rèn)為如果有明顯陰性細(xì)胞群和陽(yáng)性細(xì)胞群，應(yīng)計(jì)算百分比；無明顯分群，僅熒光強(qiáng)度發(fā)生變化的應(yīng)該用MFI。如果是整體峰移（或者叫單峰），那么根本不存在MFI之外的任何合理的指標(biāo)，不管MFI跟其它指標(biāo)吻合度如何，這就是客觀數(shù)據(jù)、客觀事實(shí)。
⒛流式檢測(cè)胞內(nèi)抗原時(shí)打孔液的配方？
打孔液有很多種，方法也有很多。與你的實(shí)驗(yàn)方法相關(guān)。我用過酒精固定或Triton X-100（我做的都是培養(yǎng)的細(xì)胞）：
（1）70%的酒精固定24小時(shí)即可，不再需要再打孔。如在PI染色測(cè)細(xì)胞周期或凋亡。
（2）Triton X-100是比較強(qiáng)烈的穿孔劑。0.1% Triton X-100/PBS（再加0.1%BSA） 是比較溫和一點(diǎn)。濃度可適當(dāng)提高。作用時(shí)間以幾分鐘為宜。這個(gè)時(shí)間必須要自己試。時(shí)間長(zhǎng)了細(xì)胞易破裂，短了則打孔不夠。如果你要染胞漿，則時(shí)間適當(dāng)短些，如果要染內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或核內(nèi)等，由于要對(duì)兩層膜性結(jié)構(gòu)打孔，時(shí)間當(dāng)然會(huì)長(zhǎng)一些
（3）可以試試0.1% saponin（皂素）
21.標(biāo)本必須在抗體染色后30分內(nèi)檢測(cè)嗎？
SOP是這么說的：
（1）Keep samples after staining covered with aluminum foil and at 4 0C （in the refrigerator） until they are run for flow analysis. The samples should be analyzed within 48 hours. Fluorescence loses its brightness if cells are not kept properly： not at 4 0C， or are exposed to light
（2）If cells are not fixed with paraformaldehyde， keep the samples on ice and run them immediately after staining is accomplished
因此，如果你沒有用PBS洗的話，可以用paraformaldehyde固定，放置48小時(shí)。洗了后應(yīng)該盡快檢測(cè)。如果做好不能及時(shí)檢測(cè)，我們一般是加入等量的2%的多聚甲醛固定，4度冰箱避光貯存。一般過夜沒有問題，第二天同樣PBS 2ml 洗滌細(xì)胞一次，上機(jī)檢測(cè)。
22.請(qǐng)問流式檢測(cè)膜蛋白表達(dá)的變化用多克隆抗體出結(jié)果的機(jī)會(huì)大嗎？
流式的抗體和WB的抗體是不同的（有部分可以通用），多抗一般是大的變性蛋白為抗原制備的，而WB的中被檢測(cè)蛋白就是變性狀態(tài)，所以很吻合，而流失中一般蛋白還是保持了天然構(gòu)象，所以產(chǎn)生的多抗可能不太好，而需要用很小特定的決定簇為抗原制備單克隆抗體。
23.在下近作人外周血流式，作表面及其胞內(nèi)染色，試劑說明書說要先分離外周血單個(gè)核細(xì)胞再染色，我有時(shí)候分的紅細(xì)胞比較多，其他的方法試過了，都改進(jìn)的不好，我擔(dān)心紅細(xì)胞會(huì)有影響，想在分離出PBMC以后如果紅細(xì)胞比較多的話，就用紅細(xì)胞裂解液裂解一下，但是我有如下問題，希望這樣做過的同志指點(diǎn)一下，感激不禁。
（1）有人這樣在分離PBMC以后再裂解的嗎（我知道一般是在全血染色后再裂解紅細(xì)胞）？
（2）這樣會(huì)影響流式檢測(cè)嗎？
（3）用的裂解液配方是什么（自己用過的）。
（4）用法是什么｛我是在如果PBMC分出來以后要是紅細(xì)胞比較多的時(shí)候使用，這樣要怎樣把分出的PBMC稀釋，加多少裂解液　裂解多長(zhǎng)時(shí)間，裂解后洗滌幾次等等｝。
我曾做骨髓液分離單個(gè)核細(xì)胞而后做流式，一般來說用Ficoll分過之后即便還有紅細(xì)胞殘留，上流式也可通過“設(shè)門”根據(jù)細(xì)胞形態(tài)大小將紅細(xì)胞剔除。若紅細(xì)胞殘留太多，則可通過紅細(xì)胞裂解液進(jìn)一步去除之。我用的裂解液配方是：
碳酸氫鉀（KHCO3） 1.0g
氯化氨（NH4CL） 8.3g
EDTA-Na2 0.037g 加雙H2O至1000ml，為工作液。
配好后4度冰箱保存，使用時(shí)效果更好。我是在Ficoll分過之后用的，所以一般根據(jù)離心后EP管里細(xì)胞團(tuán)的大小加紅細(xì)胞裂解液，通常5ml骨髓液分離單個(gè)核細(xì)胞后得到的細(xì)胞再加500ul裂解液，震蕩混勻置2－5分鐘紅細(xì)胞就基本上裂解干凈了。洗滌次數(shù)看白細(xì)胞多少而定，因?yàn)橄吹拇螖?shù)越多，損失就越多。我一般洗一到兩次就OK了．做了很久沒發(fā)現(xiàn)這樣處理影響結(jié)果。有一點(diǎn)，我是在這樣處理后才標(biāo)記抗體的，樓上的說是標(biāo)記過才溶紅細(xì)胞，所以建議在溶的時(shí)候時(shí)間不宜過長(zhǎng)，洗滌次數(shù)也不宜過多，以免將標(biāo)記上的單抗洗脫。
24.表中流式細(xì)胞儀給出的平均值是什么意思，是怎樣得到的，有些文獻(xiàn)中提到“fluorescence per cell”，是下面的mean值嗎，還是要用mean值除以第1欄的細(xì)胞數(shù)events，才能得到fluorescence per cell ？
mean 值就是每個(gè)細(xì)胞的平均熒光強(qiáng)度，不用再除細(xì)胞數(shù)。這只是個(gè)相對(duì)值，如果求值，應(yīng)用已知熒光劑濃度值對(duì)應(yīng)儀器給出的mean值，做標(biāo)準(zhǔn)曲線。以后你得到的mean值，就可以根據(jù)這條標(biāo)準(zhǔn)曲線查出真正的熒光濃度值。
25.運(yùn)用間接法流式細(xì)胞術(shù)，剛買了熒光二抗，是KPL的fluorescein-labeled affinity purified antibody to mouse IgG+IgM（H+L） produced in goat .說明說上提示要用TBS或是BSA或milk diluent/blocking solution液稀釋。稀釋至1：10～1：100。請(qǐng)問BSA是不是小牛血清，要用多少濃度的。TBS液我沒有，還有可否用注射用水稀釋。
BSA：牛血清白蛋白，濃度可以在一定范圍內(nèi)1%~5%，具體可參考其他抗體說明書。
TBS：Tris buffer saline。就是Tris的鹽溶液，很常規(guī)的溶液，配方：20mM Tris-HCl（ph8.0），150mM NaCl。
你說的注射用水應(yīng)該就是生理鹽水吧，這對(duì)抗體來說是不利的，雖然在基礎(chǔ)條件很差的情況下會(huì)用這個(gè)溶液，但是還不如PBS溶液。既然是做流式，按照正規(guī)程序操作抗體，得到的結(jié)果也能反映真實(shí)情況。
26.流式細(xì)胞檢測(cè)中怎樣把對(duì)照和樣本的檢測(cè)結(jié)果放在一張圖中？
分析獲取數(shù)據(jù)是分開進(jìn)行的，不可以混在一起上樣。首先通過陰性對(duì)照調(diào)節(jié)基本電壓，固定條件后進(jìn)行樣品檢測(cè)，分別保存結(jié)果。利用流式軟件的multigraph中的overlap可以將陰性對(duì)照和樣品結(jié)果相應(yīng)圖進(jìn)行疊加，這只是獲取數(shù)據(jù)后對(duì)結(jié)果的組合和加工。